सोधपुछ

इथियोपियाको अवशको सेबाट्किलोमा रहेको एनोफिलिस लामखुट्टेमा कीटनाशक प्रतिरोधको जीनोम-व्यापी जनसंख्या आनुवंशिकी र आणविक अनुगमन।

२०१२ मा जिबूतीमा यसको खोज भएदेखि, एसियाली एनोफिलिस स्टेफेन्सी लामखुट्टे अफ्रिकाको हर्नभरि फैलिएको छ। यो आक्रमणकारी भेक्टर महाद्वीपभरि फैलिरहेको छ, जसले मलेरिया नियन्त्रण कार्यक्रमहरूको लागि गम्भीर खतरा खडा गरेको छ। कीटनाशक-उपचार गरिएको ओछ्यानको जाली र भित्री अवशिष्ट स्प्रेइङ सहित भेक्टर नियन्त्रण विधिहरूले मलेरियाको बोझलाई उल्लेखनीय रूपमा कम गरेको छ। यद्यपि, एनोफिलिस स्टेफेन्सी जनसंख्या सहित कीटनाशक-प्रतिरोधी लामखुट्टेको बढ्दो प्रसारले चलिरहेको मलेरिया उन्मूलन प्रयासहरूलाई बाधा पुर्‍याइरहेको छ। प्रभावकारी मलेरिया नियन्त्रण रणनीतिहरूलाई मार्गदर्शन गर्न जनसंख्या संरचना, जनसंख्या बीचको जीन प्रवाह, र कीटनाशक प्रतिरोधी उत्परिवर्तनको वितरण बुझ्नु आवश्यक छ।
एन. स्टेफेन्सी कसरी HOA मा यति स्थापित भयो भन्ने बारे हाम्रो बुझाइमा सुधार गर्नु नयाँ क्षेत्रहरूमा यसको सम्भावित प्रसारको भविष्यवाणी गर्न महत्त्वपूर्ण छ। जनसंख्या संरचना, निरन्तर चयन, र जीन प्रवाहमा अन्तर्दृष्टि प्राप्त गर्न भेक्टर प्रजातिहरूको अध्ययन गर्न जनसंख्या आनुवंशिकी व्यापक रूपमा प्रयोग गरिएको छ18,19। एन. स्टेफेन्सीको लागि, जनसंख्या संरचना र जीनोम संरचनाको अध्ययनले यसको आक्रमण मार्ग र यसको उदय पछि भएको कुनै पनि अनुकूली विकासलाई स्पष्ट पार्न मद्दत गर्न सक्छ। जीन प्रवाहको अतिरिक्त, चयन विशेष गरी महत्त्वपूर्ण छ किनभने यसले कीटनाशक प्रतिरोधसँग सम्बन्धित एलिलहरू पहिचान गर्न सक्छ र यी एलिलहरू जनसंख्या मार्फत कसरी फैलिरहेका छन् भन्ने कुरामा प्रकाश पार्छ20।
आजसम्म, आक्रामक प्रजाति एनोफिलिस स्टेफेन्सीमा कीटनाशक प्रतिरोध मार्करहरू र जनसंख्या आनुवंशिकीको परीक्षण केही उम्मेदवार जीनहरूमा सीमित गरिएको छ। अफ्रिकामा प्रजातिको उदय पूर्ण रूपमा बुझिएको छैन, तर एउटा परिकल्पना यो हो कि यो मानिस वा पशुधनद्वारा शुरू गरिएको थियो। अन्य सिद्धान्तहरूमा हावाद्वारा लामो दूरीको बसाइँसराइ समावेश छ। यस अध्ययनमा प्रयोग गरिएका इथियोपियाली आइसोलेटहरू अदिस अबाबाको २०० किलोमिटर पूर्वमा अवस्थित र अदिस अबाबाको मुख्य यातायात कोरिडोरमा अवस्थित अवश सेबत किलोमा सङ्कलन गरिएको थियो। अदिस अबाबाको उच्च मलेरिया प्रसारण भएको क्षेत्र हो र यसमा एनोफिलिस स्टेफेन्सीको ठूलो जनसंख्या छ, जुन कीटनाशक प्रतिरोधी भएको रिपोर्ट गरिएको छ, जसले गर्दा यो अदिस अबाबाको जनसंख्या आनुवंशिकी अध्ययन गर्ने एक महत्त्वपूर्ण साइट बनेको छ।
इथियोपियाली जनसंख्यामा कम आवृत्तिमा कीटनाशक प्रतिरोध उत्परिवर्तन kdr L1014F पत्ता लागेको थियो र भारतीय क्षेत्र नमूनाहरूमा पत्ता लागेको थिएन। यो kdr उत्परिवर्तनले पाइरेथ्रोइड र DDT प्रतिरोध प्रदान गर्दछ र पहिले २०१६ मा भारत र २०१८ मा अफगानिस्तानमा सङ्कलन गरिएको An. stephensi जनसंख्यामा पत्ता लागेको थियो।31,32 दुवै शहरहरूमा व्यापक पाइरेथ्रोइड प्रतिरोधको प्रमाणको बावजुद, यहाँ विश्लेषण गरिएको मंगलोर र बैंगलोर जनसंख्यामा kdr L1014F उत्परिवर्तन पत्ता लागेको थिएन। यो SNP बोक्ने इथियोपियाली आइसोलेटहरूको कम अनुपात जुन विषम थियो, यसले यो जनसंख्यामा हालै उत्परिवर्तन भएको संकेत गर्छ। यो कुरालाई अवशमा गरिएको अघिल्लो अध्ययनले समर्थन गर्दछ जसले यहाँ विश्लेषण गरिएका नमूनाहरू भन्दा अघिल्लो वर्षमा सङ्कलन गरिएका नमूनाहरूमा kdr उत्परिवर्तनको कुनै प्रमाण फेला पारेन। १८ हामीले पहिले एम्प्लिकन पत्ता लगाउने दृष्टिकोण प्रयोग गरेर एउटै क्षेत्र/वर्षबाट नमूनाहरूको सेटमा कम आवृत्तिमा यो kdr L1014F उत्परिवर्तन पहिचान गर्यौं।२८ नमूना साइटहरूमा फेनोटाइपिक प्रतिरोधलाई ध्यानमा राख्दै, यस प्रतिरोध मार्करको कम एलिल आवृत्तिले सुझाव दिन्छ कि लक्ष्य साइट परिमार्जन बाहेक अन्य संयन्त्रहरू यस अवलोकन गरिएको फेनोटाइपको लागि जिम्मेवार छन्।
यस अध्ययनको एउटा सीमितता भनेको कीटनाशक प्रतिक्रियामा फेनोटाइपिक डेटाको अभाव हो। कीटनाशक प्रतिक्रियामा यी उत्परिवर्तनहरूको प्रभावको अनुसन्धान गर्न संवेदनशीलता बायोएसेससँग संयोजनमा सम्पूर्ण जीनोम सिक्वेन्सिङ (WGS) वा लक्षित एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङलाई संयोजन गर्ने थप अध्ययनहरू आवश्यक छन्। प्रतिरोधसँग सम्बन्धित हुन सक्ने यी नयाँ मिसेन्स SNP हरूलाई उच्च-थ्रुपुट आणविक परीक्षणहरूको लागि लक्षित गरिनुपर्छ जसले गर्दा प्रतिरोध फेनोटाइपहरूसँग सम्बन्धित सम्भावित संयन्त्रहरू बुझ्न र प्रमाणित गर्न अनुगमनलाई समर्थन गर्न र कार्यात्मक कार्यलाई सहज बनाउन सकिन्छ।
संक्षेपमा, यो अध्ययनले महादेशहरूमा एनोफिलिस लामखुट्टेको जनसंख्या आनुवंशिकीको गहिरो बुझाइ प्रदान गर्दछ। विभिन्न भौगोलिक क्षेत्रहरूमा नमूनाहरूको ठूलो समूहहरूमा सम्पूर्ण जीनोम अनुक्रमण (WGS) विश्लेषणको प्रयोग जीन प्रवाह बुझ्न र कीटनाशक प्रतिरोधको मार्करहरू पहिचान गर्न महत्वपूर्ण हुनेछ। यो ज्ञानले सार्वजनिक स्वास्थ्य अधिकारीहरूलाई भेक्टर निगरानी र कीटनाशक प्रयोगमा सूचित छनौटहरू गर्न सक्षम बनाउनेछ।
यस डेटासेटमा प्रतिलिपि संख्या भिन्नता पत्ता लगाउन हामीले दुई दृष्टिकोणहरू प्रयोग गर्यौं। पहिलो, हामीले कभरेज-आधारित दृष्टिकोण प्रयोग गर्यौं जुन जीनोममा पहिचान गरिएका CYP जीन क्लस्टरहरूमा केन्द्रित थियो (पूरक तालिका S5)। नमूना कभरेज सङ्कलन स्थानहरूमा औसत गरिएको थियो र चार समूहहरूमा विभाजित गरिएको थियो: इथियोपिया, भारतीय क्षेत्रहरू, भारतीय उपनिवेशहरू, र पाकिस्तानी उपनिवेशहरू। प्रत्येक समूहको लागि कभरेज कर्नेल स्मूथिंग प्रयोग गरेर सामान्यीकृत गरिएको थियो र त्यसपछि त्यो समूहको लागि मध्य जीनोम कभरेज गहिराइ अनुसार प्लट गरिएको थियो।


पोस्ट समय: जुन-२३-२०२५