DELLA प्रोटिनहरू संरक्षित मास्टर हुन्वृद्धि नियामकहरूजसले आन्तरिक र वातावरणीय संकेतहरूको प्रतिक्रियामा बिरुवाको विकासलाई नियन्त्रण गर्न केन्द्रीय भूमिका खेल्छ। DELLA ले ट्रान्सक्रिप्शनल नियामकको रूपमा काम गर्दछ र यसको GRAS डोमेन मार्फत ट्रान्सक्रिप्शन कारकहरू (TFs) र हिस्टोन H2A मा बाँधेर लक्षित प्रवर्द्धकहरूमा भर्ती गरिन्छ। हालैका अध्ययनहरूले देखाएका छन् कि DELLA स्थिरता दुई संयन्त्रहरू मार्फत अनुवाद पछि नियमन गरिएको छ: फाइटोहर्मोन गिब्बेरेलिन द्वारा प्रेरित पोलियुबिक्विटिनेशन, जसले यसको द्रुत क्षयीकरण निम्त्याउँछ, र यसको संचय बढाउन सानो युबिक्विटिन-जस्तै परिमार्जकहरू (SUMO) को संयोजन। थप रूपमा, DELLA गतिविधि दुई फरक ग्लाइकोसिलेशनहरू द्वारा गतिशील रूपमा विनियमित हुन्छ: DELLA-TF अन्तरक्रिया O-fucosylation द्वारा बढाइएको छ तर O-लिङ्क गरिएको N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) परिमार्जन द्वारा रोकिएको छ। यद्यपि, DELLA फस्फोरिलेसनको भूमिका अस्पष्ट रहन्छ, किनकि अघिल्ला अध्ययनहरूले विवादास्पद परिणामहरू देखाएका छन्, जसमा फस्फोरिलेसनले DELLA डिग्रेडेसनलाई बढावा दिन्छ वा घटाउँछ भनेर देखाउनेहरूदेखि लिएर फस्फोरिलेसनले यसको स्थिरतालाई असर गर्दैन भनेर देखाउनेहरू सम्मिलित छन्। यहाँ, हामी REPRESSOR मा फस्फोरिलेसन साइटहरू पहिचान गर्छौं।ga1-3 ले(RGA, AtDELLA) मास स्पेक्ट्रोमेट्री विश्लेषणद्वारा Arabidopsis thaliana बाट शुद्ध गरिएको र देखाउँछ कि PolyS र PolyS/T क्षेत्रहरूमा दुई RGA पेप्टाइडहरूको फस्फोरिलेसनले H2A बाइन्डिङ र बढाइएको RGA गतिविधिलाई बढावा दिन्छ। लक्षित प्रवर्द्धकहरूसँग RGA को सम्बन्ध। उल्लेखनीय रूपमा, फस्फोरिलेसनले RGA-TF अन्तरक्रिया वा RGA स्थिरतालाई असर गर्दैन। हाम्रो अध्ययनले आणविक संयन्त्र प्रकट गर्दछ जसद्वारा फस्फोरिलेसनले DELLA गतिविधिलाई प्रेरित गर्छ।
DELLA प्रकार्यलाई नियमन गर्न फस्फोरिलेसनको भूमिका स्पष्ट पार्न, भिभोमा DELLA फस्फोरिलेसन साइटहरू पहिचान गर्नु र बिरुवाहरूमा कार्यात्मक विश्लेषणहरू गर्नु महत्त्वपूर्ण छ। MS/MS विश्लेषण पछि बिरुवाको अर्कको आत्मीयता शुद्धीकरण गरेर, हामीले RGA मा धेरै फस्फोसाइटहरू पहिचान गर्यौं। GA को कमीको अवस्थामा, RHA फस्फोरिलेसन बढ्छ, तर फस्फोरिलेसनले यसको स्थिरतालाई असर गर्दैन। महत्त्वपूर्ण रूपमा, co-IP र ChIP-qPCR परीक्षणहरूले RGA को PolyS/T क्षेत्रमा फस्फोरिलेसनले H2A सँगको अन्तरक्रिया र लक्षित प्रमोटरहरूसँगको यसको सम्बन्धलाई बढावा दिन्छ, जसले गर्दा फस्फोरिलेसनले RGA प्रकार्यलाई प्रेरित गर्ने संयन्त्र प्रकट गर्दछ।
LHR1 सबडोमेनको TF सँगको अन्तरक्रिया मार्फत लक्षित क्रोमेटिनमा RGA भर्ती गरिन्छ र त्यसपछि यसको PolyS/T क्षेत्र र PFYRE सबडोमेन मार्फत H2A मा बाँधिन्छ, RGA लाई स्थिर गर्न H2A-RGA-TF कम्प्लेक्स बनाउँछ। DELLA डोमेन र GRAS डोमेन बीचको PolyS/T क्षेत्रमा Pep 2 को फास्फोरिलेसनले RGA-H2A बाइन्डिङलाई बढाउँछ। rgam2A उत्परिवर्ती प्रोटीनले RGA फस्फोरिलेसनलाई खारेज गर्छ र H2A बाइन्डिङमा हस्तक्षेप गर्न फरक प्रोटीन कन्फर्मेसन अपनाउँछ। यसले क्षणिक TF-rgam2A अन्तरक्रियाको अस्थिरता र लक्ष्य क्रोमेटिनबाट rgam2A को पृथक्करणमा परिणाम दिन्छ। यो चित्रले RGA-मध्यस्थ ट्रान्सक्रिप्शनल दमन मात्र चित्रण गर्दछ। RGA-मध्यस्थ ट्रान्सक्रिप्शनल सक्रियताको लागि समान ढाँचा वर्णन गर्न सकिन्छ, बाहेक H2A-RGA-TF कम्प्लेक्सले लक्षित जीन ट्रान्सक्रिप्शनलाई बढावा दिनेछ र rgam2A को डिफोस्फोरिलेसनले ट्रान्सक्रिप्शन घटाउनेछ। Huang et al.21 बाट परिमार्जित चित्र।
सबै मात्रात्मक डेटालाई एक्सेल प्रयोग गरेर तथ्याङ्कीय रूपमा विश्लेषण गरिएको थियो, र विद्यार्थीको t परीक्षण प्रयोग गरेर महत्त्वपूर्ण भिन्नताहरू निर्धारण गरिएको थियो। प्रारम्भिक रूपमा नमूना आकार निर्धारण गर्न कुनै पनि तथ्याङ्कीय विधिहरू प्रयोग गरिएको थिएन। विश्लेषणबाट कुनै पनि डेटा बहिष्कृत गरिएको थिएन; प्रयोग अनियमित गरिएको थिएन; अनुसन्धानकर्ताहरू प्रयोगको क्रममा डेटाको वितरण र परिणामहरूको मूल्याङ्कनप्रति अन्धा थिएनन्। नमूना आकार चित्र कथा र स्रोत डेटा फाइलमा संकेत गरिएको छ।
अध्ययन डिजाइनको बारेमा थप जानकारीको लागि, यस लेखसँग सम्बन्धित प्राकृतिक पोर्टफोलियो रिपोर्ट सारांश हेर्नुहोस्।
मास स्पेक्ट्रोमेट्री प्रोटियोमिक्स डेटा डेटासेट पहिचानकर्ता PXD046004 सहितको PRIDE66 पार्टनर रिपोजिटरी मार्फत प्रोटियोमएक्सचेन्ज कन्सोर्टियममा योगदान गरिएको छ। यस अध्ययनको क्रममा प्राप्त गरिएका अन्य सबै डेटा पूरक जानकारी, पूरक डेटा फाइलहरू, र कच्चा डेटा फाइलहरूमा प्रस्तुत गरिएका छन्। यस लेखको लागि स्रोत डेटा प्रदान गरिएको छ।
पोस्ट समय: नोभेम्बर-०८-२०२४