inquirybg

Phosphorylation ले Arabidopsis मा मास्टर ग्रोथ रेगुलेटर DELLA लाई क्रोमाटिनसँग हिस्टोन H2A को सम्बन्धलाई बढावा दिएर सक्रिय गर्दछ।

DELLA प्रोटिनहरू संरक्षित मास्टर हुन्वृद्धि नियामकहरूजसले आन्तरिक र वातावरणीय संकेतहरूको प्रतिक्रियामा बिरुवाको विकासलाई नियन्त्रण गर्न केन्द्रीय भूमिका खेल्छ। DELLA ले ट्रान्सक्रिप्शनल नियामकको रूपमा कार्य गर्दछ र यसको GRAS डोमेन मार्फत ट्रान्सक्रिप्शन कारकहरू (TFs) र हिस्टोन H2A लाई बाध्य पारेर प्रवर्द्धकहरूलाई लक्षित गर्न भर्ती गरिन्छ। हालैका अध्ययनहरूले देखाएको छ कि DELLA स्थिरता पोस्ट-ट्रान्सलेसनली दुई संयन्त्रहरू मार्फत विनियमित हुन्छ: फाइटोहर्मोन गिब्बेरेलिन द्वारा प्रेरित पोलीयुबिक्विटनेशन, जसले यसको द्रुत ह्रास निम्त्याउँछ, र यसको संचय बढाउन सानो ubiquitin-जस्तै परिमार्जक (SUMO) को संयोजन। थप रूपमा, DELLA गतिविधि गतिशील रूपमा दुई फरक ग्लाइकोसिलेशन द्वारा विनियमित छ: DELLA-TF अन्तरक्रिया O-fucosylation द्वारा बढाइएको छ तर O-linked N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) परिमार्जन द्वारा रोकिएको छ। यद्यपि, DELLA फास्फोरिलेसनको भूमिका अस्पष्ट रहन्छ, किनकि अघिल्लो अध्ययनहरूले विरोधाभासी परिणामहरू देखाएको छ, फास्फोरिलेसनले यसको स्थिरतालाई असर गर्दैन भनेर देखाउने अन्यहरूलाई DELLA गिरावटलाई बढावा दिन्छ वा घटाउँछ भन्ने देखाउने देखि लिएर। यहाँ, हामी REPRESSOR मा phosphorylation साइटहरू पहिचान गर्छौंga1-3(RGA, AtDELLA) मास स्पेक्ट्रोमेट्री विश्लेषण द्वारा Arabidopsis thaliana बाट शुद्ध गरिएको छ र PolyS र PolyS/T क्षेत्रहरूमा दुई RGA पेप्टाइडहरूको फस्फोरिलेसनले H2A बाध्यकारी र उन्नत RGA गतिविधिलाई बढावा दिन्छ। लक्षित प्रवर्द्धकहरु संग RGA को संघ। विशेष गरी, फास्फोरिलेसनले RGA-TF अन्तरक्रिया वा RGA स्थिरतालाई असर गर्दैन। हाम्रो अध्ययनले आणविक संयन्त्रलाई प्रकट गर्दछ जसद्वारा फास्फोरिलेसनले DELLA गतिविधिलाई प्रेरित गर्दछ।
DELLA प्रकार्य को नियमन मा phosphorylation को भूमिका को स्पष्ट गर्न को लागी, vivo मा DELLA phosphorylation साइटहरु को पहिचान गर्न र बिरुवाहरु मा कार्यात्मक विश्लेषण गर्न को लागी महत्वपूर्ण छ। MS/MS विश्लेषण पछि बिरुवाको अर्कको आत्मीयता शुद्धीकरणद्वारा, हामीले RGA मा धेरै फस्फोसाइटहरू पहिचान गर्यौं। GA कमीको अवस्थामा, RHA फास्फोरिलेसन बढ्छ, तर फास्फोरिलेसनले यसको स्थिरतालाई असर गर्दैन। महत्त्वपूर्ण रूपमा, सह-आईपी र ChIP-qPCR एसेहरूले खुलासा गरे कि RGA को PolyS/T क्षेत्रमा फास्फोरिलेसनले H2A सँग यसको अन्तरक्रिया र लक्ष्य प्रवर्द्धकहरूसँगको सम्बन्धलाई बढावा दिन्छ, जसले फस्फोरिलेसनले RGA प्रकार्यलाई प्रेरित गर्ने संयन्त्रलाई प्रकट गर्दछ।
RGA लाई TF सँग LHR1 सबडोमेनको अन्तरक्रिया मार्फत क्रोमाटिन लक्षित गर्न भर्ती गरिन्छ र त्यसपछि H2A सँग यसको PolyS/T क्षेत्र र PFYRE सबडोमेन मार्फत बाँधिन्छ, RGA लाई स्थिर गर्न H2A-RGA-TF जटिल बनाउँछ। अज्ञात किनेज द्वारा DELLA डोमेन र GRAS डोमेन बीचको PolyS/T क्षेत्रमा Pep 2 को Phosphorylation ले RGA-H2A बाइन्डिङ बढाउँछ। rgam2A उत्परिवर्ती प्रोटीनले RGA फास्फोरिलेसनलाई समाप्त गर्छ र H2A बाइन्डिङमा हस्तक्षेप गर्न फरक प्रोटीन कन्फर्मेसन अपनाउँछ। यसले क्षणिक TF-rgam2A अन्तरक्रियाको अस्थिरता र लक्ष्य क्रोमाटिनबाट rgam2A को विच्छेदनमा परिणाम दिन्छ। यो आंकडा केवल RGA- मध्यस्थ ट्रान्सक्रिप्शनल दमन चित्रण गर्दछ। समान ढाँचा RGA- मध्यस्थ ट्रान्सक्रिप्शनल सक्रियताको लागि वर्णन गर्न सकिन्छ, बाहेक H2A-RGA-TF कम्प्लेक्सले लक्ष्य जीन ट्रान्सक्रिप्शनलाई बढावा दिनेछ र rgam2A को डिफोस्फोरिलेसनले ट्रान्सक्रिप्शन घटाउनेछ। Huang et al.21 बाट परिमार्जन गरिएको चित्र।
सबै मात्रात्मक डेटाहरू एक्सेल प्रयोग गरेर सांख्यिकीय रूपमा विश्लेषण गरियो, र विद्यार्थीको t परीक्षण प्रयोग गरेर महत्त्वपूर्ण भिन्नताहरू निर्धारण गरियो। प्रारम्भिक रूपमा नमूना आकार निर्धारण गर्न कुनै सांख्यिकीय विधिहरू प्रयोग गरिएन। विश्लेषणबाट कुनै डेटा बहिष्कृत गरिएको थिएन; प्रयोग अनियमित थिएन; शोधकर्ताहरू प्रयोगको क्रममा डाटाको वितरण र परिणामहरूको मूल्याङ्कनमा अन्धा थिएनन्। नमूना आकार फिगर लेजेन्ड र स्रोत डेटा फाइलमा संकेत गरिएको छ।
अध्ययन डिजाइनको बारेमा थप जानकारीको लागि, यस लेखसँग सम्बन्धित प्राकृतिक पोर्टफोलियो रिपोर्ट सार हेर्नुहोस्।
मास स्पेक्ट्रोमेट्री प्रोटिओमिक्स डेटा डेटासेट पहिचानकर्ता PXD046004 सँग PRIDE66 साझेदार भण्डार मार्फत ProteomeXchange कन्सोर्टियममा योगदान गरिएको छ। यस अध्ययनको क्रममा प्राप्त गरिएका अन्य सबै डाटाहरू पूरक जानकारी, पूरक डाटा फाइलहरू, र कच्चा डाटा फाइलहरूमा प्रस्तुत गरिएका छन्। यस लेखको लागि स्रोत डेटा प्रदान गरिएको छ।

 

पोस्ट समय: नोभेम्बर-08-2024